植物殘?bào)w發(fā)酵過(guò)程有不同種類(lèi)微生物參與。由于不同植物殘?bào)w原料和發(fā)酵條件的變化，各種微生物數(shù)量也在不斷發(fā)生變化，所以植物殘?bào)w發(fā)酵過(guò)程沒(méi)有仟何微生物始終占據(jù)主導(dǎo)地位，每一個(gè)環(huán)境都有其特定的微生物種群。參與植物殘?bào)w發(fā)酵過(guò)程的主要微生物種類(lèi)是細(xì)菌、
真菌、放線(xiàn)菌，它們都有中溫和高溫菌。
1）細(xì)菌 在好氧發(fā)酵過(guò)程中，存在著大量的細(xì)菌。細(xì)菌憑借大的比表面，可以快速吸收植物殘?bào)w中可溶性物質(zhì)，使其快速增長(zhǎng)。發(fā)酵初期，溫度較低，主要以嗜溫細(xì)菌為主，隨著發(fā)酵堆溫度的提高，嗜溫細(xì)菌逐漸減少，一些芽孢桿菌成為細(xì)菌的主體，在降溫階段，嗜溫細(xì)菌的數(shù)量有所回升。
2）放線(xiàn)菌 放線(xiàn)菌是多細(xì)胞菌絲的細(xì)菌，可以分解纖維素、半纖維素、木質(zhì)素等。它們沒(méi)有真菌分解纖維素、半纖維素、木質(zhì)素的能力強(qiáng)，但比真菌更能耐高溫和高pH，因此在發(fā)酵的高溫期是降解纖維素、半纖維素、木質(zhì)素的優(yōu)勢(shì)菌群。
3）真菌 真菌對(duì)植物殘?bào)w的發(fā)酵腐熟具有重要意義，嗜溫性真菌地霉菌和嗜熱性真菌煙曲霉是發(fā)酵過(guò)程的優(yōu)勢(shì)菌群。溫度是影響真菌生長(zhǎng)的*重要因素之一，*大部分真菌是嗜溫真菌，在5～37℃的環(huán)境中存在，當(dāng)溫度升到64℃時(shí)，幾乎所有真菌都消失。當(dāng)發(fā)酵后期，溫度下降到60℃時(shí)，嗜溫性真菌和嗜熱性真菌又會(huì)出現(xiàn)。
總之，在植物殘?bào)w發(fā)酵過(guò)程中主要依靠微生物的作用進(jìn)行，微生物是發(fā)酵的主體，其來(lái)源一是自然界，二是人工接種。在發(fā)酵過(guò)程中，高溫會(huì)將植物殘?bào)w中的病原菌、蟲(chóng)卵、雜草種子殺死。
